瞿曇寺，藏語(yǔ)稱(chēng)“卓倉(cāng)拉果丹代”，亦稱(chēng)“卓倉(cāng)多杰羌”，意為“樂(lè)都持金剛佛寺”位于青海省海東州樂(lè)都縣曲壇鄉(xiāng)所在地，南距縣城約17公里。該寺是樂(lè)都南山地區(qū)最大的寺院。

瞿曇寺創(chuàng)建于明洪二十五年(1392年)，開(kāi)創(chuàng)者三羅喇嘛桑杰扎西，明朝受封西寧僧綱司都綱，是西寧衛(wèi)的宗教首領(lǐng)。該寺的創(chuàng)建及后來(lái)的擴(kuò)建，都得到明王朝的大刀扶持，明太祖朱無(wú)璋書(shū)匾賜名“瞿曇寺”，以后歷代亦多次賜匾額、修佛堂、立碑記、封國(guó)師、賜印誥，影響頗大。

瞿曇寺原屬藏傳佛教噶瑪噶舉派寺院，明末格魯派崛起后，改宗格魯派，出現(xiàn)了智合倉(cāng)、卓倉(cāng)曼巴倉(cāng)、卓倉(cāng)居巴倉(cāng)三個(gè)轉(zhuǎn)世活佛系統(tǒng)。其中智合倉(cāng)以該寺開(kāi)創(chuàng)者海喇嘛為第一世，成為該寺寺主。實(shí)際智合倉(cāng)的轉(zhuǎn)世系統(tǒng)始于康熙年間受封為“灌頂凈覺(jué)弘濟(jì)大國(guó)師”的班覺(jué)丹增。二世羅桑丹具尼瑪、三世噶丹增嘉措、四世羅桑噶桑嘉措曾先后擔(dān)任搭爾寺第三十六任、五十六任、七十六任法臺(tái)。卓倉(cāng)曼巴倉(cāng)、卓倉(cāng)居巴倉(cāng)系統(tǒng)的羅桑貢卻尼瑪和噶扎西嘉措，曾任搭爾寺曼巴扎倉(cāng)第十五任堪布和塔爾寺居巴倉(cāng)第三十九任堪布及五十任法臺(tái)。歷史上瞿曇寺曾領(lǐng)屬十三寺。

作為我國(guó)西北地區(qū)保存最完整、規(guī)模宏闊而又質(zhì)量精良的明朝寺院，瞿曇寺被列為全國(guó)重點(diǎn)文物保護(hù)單位。1949年后多次撥款維修。整個(gè)寺院依山傍水，高低錯(cuò)落，氣勢(shì)宏偉。全寺共三個(gè)院落，由山門(mén)、左右碑亭、金剛段、瞿曇寺殿、寶光殿、隆國(guó)殿、護(hù)法殿、三世殿以及左右迥廊、鐘鼓樓等主要建筑組成，有“小故宮”之美稱(chēng)。全寺建筑共占地41.36畝，以瞿曇寺殿(明洪武二十五年)、寶光殿(明永樂(lè)十六年)、隆國(guó)殿(明宣德二年)為主體建筑，整個(gè)布局及殿堂裝飾具有明朝宮殿風(fēng)格。寺內(nèi)現(xiàn)存明朝漢藏文對(duì)照御制碑和明清匾額十塊、明宣德二年鑄造的青銅巨鐘一口、香爐三鼎、明鈸、象牙佛珠、檀香木佛珠、石雕米拉日巴像，以及明清統(tǒng)治者所賜金印、象牙塔、景泰藍(lán)花瓶等多珍貴文物。該寺廂廊壁畫(huà)約四百平方米，主要內(nèi)容為佛本生故事，構(gòu)思奇巧、形象逼真、技法純熟，風(fēng)格似敦煌壁畫(huà)，具有極高的藝術(shù)和研究?jī)r(jià)值，堪為國(guó)家級(jí)至寶。殿堂建筑中，以隆國(guó)殿最為富麗堂皇，型制獨(dú)特。其月臺(tái)石欄、殿堂隔扇雕造雄渾精美，被譽(yù)為明朝小木作中的杰作。寺內(nèi)佛塔四座，以度母塔最為古老。珍藏《甘珠爾》《丹珠爾》、《宗喀巴大師文集》等佛經(jīng)著述三百余部，并有自印度迎請(qǐng)的舍利近百粒，供奉于佛塔中。重要植物有明末清初所植樹(shù)的白旃檀樹(shù)。

瞿曇寺興于明朝，清中葉后漸衰。1949年前寺僧六十余人。1958年后，瞿曇寺成為全省被保留的十一座藏傳寺院之一，“文革”期間關(guān)閉，1980年重新開(kāi)放。